Осуждения
Особая тройка при УНКВД СССР по Горьковскому краю 
17/12/1937 
Обвинение "член к/р церковной диверсионно-террористической организации, а/с деятельность, направленная на свержение существующего строя, участие в нелегальных а/с сборищах духовенства" 
Статья ст.58–10 ч.1,58–11 УК РСФСР 
Приговор высшая мера наказания — расстрел с конфискацией имущества 
Групповое дело "дело протоиерея Павла Устинова и др. Муром, 1937г." 
Из обвинительного заключения:
    "Состоя членом к/р церковной диверсионно-террористической организации,
     созданной в Муромском районе по заданию бывшего епископа Муромского
     Макария (Звездова), на нелегальных сборищах духовенства
     в церкви под руководством благочинного Гладышева И.И. и на квартире
     епископа Симеона (Михайлова) принимал участие в обсуждении и выработке
     мероприятий по борьбе с Советской властью. Систематически проводил к/р
     агитацию, направленную против мероприятий ВКП(б) и Советского правительства".

Ни в одном из предъявленных обвинений о.Иоанникий виновным себя не признал
и показаний ни на кого из остальных обвиняемых не дал