Места заключения
Вятлаг 
Год начала 1949 
Месяц начала 11 
Год окончания 1955 
О.Рафаил, слабый и совершено больной (ему было уже за 60 лет), сидел с
уголовниками. Без него был освящен храм, и о.Сергий стал там настоятелем. В
письмах из лагеря о.Рафаил умолял своих духовных чад "простить Наташу" (которая
прислала ему покаянное письмо о своем грехе доносительства), и писал о
том, что без воли Божией "Ни влас с головы не пропадет", что нужно смиряться
перед волей Божией, в какой бы тяжелой форме она ни выражалась".

16 ноября 1953г. бывшая староста Наталья Александрова направила заявление
в Верховный Совет:
    "Прошу Верховный Совет ответить на заявление православных верующих города
     Козельска Калужской области... Просим вашего ходатайства освободить
     нашего священника Шейченко Родиона Ивановича по старости,
     ему шестьдесят три года, инвалид.
     Со стороны областного уполномоченного... нанесена на него ложь и клевета,
     я подтверждаю своей подписью, а если потребуется, я все могу объяснить".

Все хлопоты верующих об освобождении о.Рафаила остались бесплодными.
30 августа 1954г. Центральная Комиссия по пересмотру дел на лиц,
осужденных за контрреволюционные преступления, содержащихся в лагерях,
колониях и тюрьмах МВД СССР и находящихся в ссылке на поселении,
оставила приговор в силе.
В лагере он провел 5 лет и 8 месяцев